MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB02

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017183	GCT	2	6	7	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017183	TCT	2	6	313	318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017183	AG	3	6	374	379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017183	A	7	7	414	420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017183	TGT	2	6	452	457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017183	GGT	2	6	463	468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017183	CT	3	6	513	518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017183	GGGA	2	8	531	538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017183	CGAT	2	8	566	573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017183	ACCT	2	8	638	645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017183	CCG	2	6	649	654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017183	GCC	2	6	678	683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017183	ACC	2	6	770	775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017183	ACCG	2	8	844	851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017183	TGC	2	6	920	925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017183	CAA	2	6	962	967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017183	GC	3	6	2508	2513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017183	AAT	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017183	TTTG	2	8	2638	2645	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017183	CTG	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017183	GCA	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017183	CAG	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017183	TG	3	6	2899	2904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017183	CTG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017183	GCT	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017183	TCT	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017183	AG	3	6	3433	3438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017183	CAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017183	CT	3	6	3490	3495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017183	CT	3	6	3498	3503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017183	GCT	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017183	AGG	2	6	3566	3571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017183	CCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017183	ATA	2	6	3602	3607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017183	AAC	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017183	CCCG	2	8	3647	3654	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_017183	GGTT	2	8	3734	3741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017183	TTC	2	6	3750	3755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017183	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017183	AG	3	6	3877	3882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017183	AAT	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017183	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017183	GTG	2	6	4021	4026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017183	TCT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017183	GATTT	2	10	4335	4344	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017183	A	6	6	4361	4366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017183	TAA	2	6	4466	4471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017183	TGC	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017183	TGC	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017183	GAA	2	6	10781	10786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017183	TGC	2	6	10788	10793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017183	GCGG	2	8	10797	10804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017183	GCGGG	2	10	10881	10890	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017183	GCT	2	6	10892	10897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017183	TGCA	2	8	10910	10917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017183	TCT	2	6	10977	10982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017183	GAC	2	6	10983	10988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017183	TCG	2	6	11140	11145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017183	GGC	2	6	11217	11222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017183	TCA	2	6	11233	11238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017183	GGCTGG	2	12	11248	11259	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017183	AGG	2	6	11280	11285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017183	CGTT	2	8	11311	11318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017183	TGC	2	6	11336	11341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017183	T	7	7	11497	11503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017183	TTC	2	6	11506	11511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017183	CTT	2	6	11543	11548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017183	ATATA	2	10	11647	11656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017183	A	7	7	11692	11698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017183	ATA	2	6	11739	11744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017183	GTAA	2	8	11752	11759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017183	TATC	2	8	11777	11784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017183	TA	3	6	11785	11790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017183	TATAAT	2	12	11794	11805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017183	ATC	2	6	15623	15628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017183	A	7	7	15672	15678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017183	AGA	2	6	15699	15704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017183	AT	3	6	15710	15715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017183	ACGA	2	8	15727	15734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017183	ATCT	2	8	15741	15748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017183	TCC	2	6	15773	15778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017183	CTG	2	6	15796	15801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017183	TCT	2	6	15819	15824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017183	TTG	2	6	15877	15882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017183	TC	3	6	15895	15900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017183	TA	3	6	15917	15922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017183	CT	3	6	15924	15929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017183	AGC	2	6	15978	15983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017183	GC	3	6	16035	16040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017183	A	6	6	16057	16062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017183	CAT	2	6	16069	16074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017183	T	7	7	16091	16097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017183	TCA	2	6	16147	16152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017183	TGT	2	6	16157	16162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017183	TCAA	2	8	16189	16196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017183	TA	3	6	16824	16829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017183	TA	3	6	17490	17495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017183	TA	3	6	17498	17503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017183	TAAA	2	8	17859	17866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017183	T	6	6	17869	17874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017183	TTA	2	6	18130	18135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017183	GAT	2	6	18141	18146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017183	GGC	2	6	18153	18158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017183	AAC	2	6	18239	18244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017183	ATT	2	6	18384	18389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017183	ATG	2	6	18394	18399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017183	A	6	6	18402	18407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017183	AT	3	6	18410	18415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017183	ATT	2	6	18558	18563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017183	AAG	2	6	18571	18576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017183	A	6	6	18579	18584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017183	TATAA	2	10	18597	18606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017183	ATA	2	6	18639	18644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017183	T	6	6	18652	18657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017183	A	7	7	18664	18670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017183	TTA	2	6	18694	18699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017183	ACT	2	6	20713	20718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017183	GA	3	6	20725	20730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017183	TGG	2	6	20785	20790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017183	A	6	6	20815	20820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017183	ATT	2	6	20874	20879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017183	TTACTA	2	12	20883	20894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017183	CTCAA	2	10	21711	21720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017183	GACT	2	8	21861	21868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017183	GAA	2	6	22005	22010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017183	TTA	2	6	22016	22021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017183	G	6	6	22095	22100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017183	A	6	6	22146	22151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017183	ATA	2	6	22162	22167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017183	A	6	6	22211	22216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017183	ATG	2	6	22278	22283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017183	T	6	6	22310	22315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017183	TCT	2	6	23481	23486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017183	T	6	6	23563	23568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017183	TA	3	6	23592	23597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017183	TAT	2	6	23640	23645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017183	GA	3	6	23684	23689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017183	TTA	2	6	23710	23715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017183	AGAA	2	8	23757	23764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017183	T	6	6	25089	25094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017183	T	7	7	25112	25118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017183	A	6	6	25126	25131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017183	ATA	2	6	25141	25146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017183	T	6	6	25164	25169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017183	TTTC	2	8	25205	25212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017183	TCAA	2	8	25221	25228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017183	A	7	7	25256	25262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017183	T	6	6	25269	25274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017183	TA	3	6	25291	25296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017183	ATG	2	6	25315	25320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017183	TTTGA	2	10	25375	25384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017183	AAT	2	6	25390	25395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017183	ATT	2	6	25400	25405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017183	T	6	6	25441	25446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017183	GGC	2	6	25490	25495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017183	T	6	6	26296	26301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017183	TATT	2	8	28117	28124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017183	TTCGC	2	10	28137	28146	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_017183	TAA	2	6	28223	28228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017183	AGT	2	6	28883	28888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017183	AT	3	6	28906	28911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017183	ATT	2	6	28945	28950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017183	T	6	6	28959	28964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017183	GTC	2	6	28965	28970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017183	GTAC	2	8	29096	29103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_017183	AAGG	2	8	29126	29133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017183	GAAG	2	8	29160	29167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017183	TTA	2	6	29228	29233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017183	ATG	2	6	29251	29256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017183	T	6	6	29291	29296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017183	GAA	2	6	29322	29327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017183	AAT	2	6	29412	29417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017183	CAC	2	6	29427	29432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_017183	CTAT	2	8	29492	29499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_017183	AAG	2	6	29535	29540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017183	ACC	2	6	29564	29569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_017183	CATG	2	8	29612	29619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_017183	ACGC	2	8	29700	29707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_017183	TAT	2	6	29739	29744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017183	TCA	2	6	29854	29859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_017183	TGA	2	6	29965	29970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017183	GAT	2	6	30112	30117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017183	ATG	2	6	30201	30206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017183	T	6	6	30267	30272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017183	T	6	6	30278	30283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017183	A	7	7	30346	30352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017183	T	6	6	30383	30388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017183	TAA	2	6	30472	30477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017183	A	7	7	30476	30482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017183	CT	3	6	30486	30491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
191	NC_017183	CTT	2	6	30528	30533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_017183	AAGA	2	8	30635	30642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017183	AAG	2	6	30663	30668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017183	TCT	2	6	30719	30724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_017183	GAT	2	6	30749	30754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017183	AGA	2	6	30757	30762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017183	TC	3	6	30772	30777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
198	NC_017183	TCT	3	9	30780	30788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_017183	CTT	2	6	30869	30874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_017183	CT	4	8	30918	30925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
201	NC_017183	CTC	2	6	30933	30938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
202	NC_017183	A	6	6	30973	30978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_017183	TTAT	2	8	31120	31127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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205	NC_017183	TGGG	2	8	31186	31193	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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207	NC_017183	ATAA	2	8	31296	31303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_017183	GAC	2	6	31346	31351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
210	NC_017183	T	6	6	31472	31477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_017183	CCG	2	6	31926	31931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.